Видалення зубів як метод лікування деформацій використовують за наявності другої форми феномену Попова—Годона та значної зміни оклюзійної площини, а також у разі вираженої рухомості зубів чи хронічних періапікальних процесів, що не піддаються консервативному лікуванню.

У разі різкої гіпертрофії коміркового відростка чи частини, коли описані вище методи не призвели до бажаних результатів або вони не можуть бути використані, показано видалення зубів, а також часткова резекція коміркового відростка чи горба верхньої щелепи. Рівень резекції залежить від розміщення верхньощелепної (гайморової) пазухи, тому перед операцією необхідно отримати бічні рентгенологічні знімки пазухи з метою визначення можливого обсягу оперативного втручання.